38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1517 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  100 
 
 		 375 aa  774    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  45.25 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  34.48 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  34.03 
 
 		 415 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  35.1 
 
 		 407 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  31.36 
 
 		 442 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  31.14 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  31.14 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  30.56 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.71 
 
 		 900 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  34.74 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  31.02 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  31.44 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  28.97 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  30.33 
 
 		 520 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  25.69 
 
 		 533 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.02 
 
 		 519 aa  86.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  28.75 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 1231 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  25.25 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  30.11 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  27.52 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  24.05 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  25.36 
 
 		 644 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  26.83 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  26.83 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.85 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  23.44 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  25.28 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  26.9 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.91 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  25.83 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  25.83 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  25 
 
 		 558 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>