50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1162 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  100 
 
 		 520 aa  1026    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  56.48 
 
 		 519 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  36.36 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  33.64 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  32.91 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  31.38 
 
 		 334 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  30.95 
 
 		 442 aa  147  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 		 330 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  31.88 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  33.45 
 
 		 900 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  31.86 
 
 		 490 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  30.86 
 
 		 300 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  30.86 
 
 		 285 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  30.86 
 
 		 285 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  30.04 
 
 		 533 aa  96.7  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  30.63 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  33.18 
 
 		 519 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  30.33 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 		 1231 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  32.14 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  27.85 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  26.84 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  27.78 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  30 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  24.9 
 
 		 335 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  27.4 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  28.33 
 
 		 374 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.22 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  27.27 
 
 		 649 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  24.82 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5243  hypothetical protein  28.34 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  25.56 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  23.79 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  26.54 
 
 		 351 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  25.11 
 
 		 357 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  25.9 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  25.9 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  23.18 
 
 		 901 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  26.67 
 
 		 496 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  25.45 
 
 		 620 aa  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0950  hypothetical protein  26.96 
 
 		 530 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.184254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  27.01 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  28.24 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  26.53 
 
 		 644 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  31.25 
 
 		 366 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  23.5 
 
 		 577 aa  47.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 591 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  27.65 
 
 		 314 aa  44.3  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  24.07 
 
 		 652 aa  43.9  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  35.63 
 
 		 825 aa  43.5  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>