41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7663 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  750    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  31.55 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  28.77 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  29.86 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  28.61 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0950  hypothetical protein  28.16 
 
 		 530 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.184254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  33.16 
 
 		 620 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  28.63 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  28.24 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  28.24 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  24.03 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  27.18 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  28.57 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  28.9 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 		 1231 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  28.3 
 
 		 900 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  27.81 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  21.2 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  28.51 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  25.42 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  27.4 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  23.81 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  26.97 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  30.99 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5243  hypothetical protein  25.51 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.367518 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  25.15 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  25.9 
 
 		 314 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  29.51 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  27.09 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  26.94 
 
 		 519 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  23.59 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  25.77 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  28.1 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  23.86 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  31.25 
 
 		 520 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  25.4 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  25.4 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  27.51 
 
 		 880 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  28.57 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.66 
 
 		 886 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>