55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0209 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  100 
 
 		 351 aa  710    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  45.14 
 
 		 375 aa  289  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  36.63 
 
 		 415 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  36.53 
 
 		 490 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  35.83 
 
 		 900 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  34.71 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  34.51 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  31.89 
 
 		 442 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  32.29 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  32.29 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  32.29 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  28.77 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  34.76 
 
 		 519 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  32.26 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  28.97 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  31.87 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  25.56 
 
 		 533 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  25.82 
 
 		 367 aa  85.9  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  25.27 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  25.48 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  27.96 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  28.1 
 
 		 620 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  28.21 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  22.33 
 
 		 1231 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  28.46 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  23.55 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  23.12 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  26.61 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  26.75 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  29.51 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  25.99 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  27.98 
 
 		 605 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  22.47 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  31.03 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  25.43 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  29.09 
 
 		 649 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  25 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  23.81 
 
 		 558 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  25.12 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  28.93 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  25.89 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  32.98 
 
 		 613 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.53 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  29.15 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  27.94 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  31.62 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  25 
 
 		 644 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  31.41 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  29.51 
 
 		 496 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  31.4 
 
 		 524 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.63 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.75 
 
 		 886 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 880 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  30 
 
 		 901 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>