55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1791 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  99.67 
 
 		 299 aa  607  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  86.25 
 
 		 307 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  56.25 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  49.51 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  46.1 
 
 		 314 aa  292  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  46.26 
 
 		 321 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  50.58 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  48.65 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  49.03 
 
 		 322 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  38.49 
 
 		 880 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.69 
 
 		 886 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  26.55 
 
 		 558 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  32.64 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  32.64 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  32.64 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  31.3 
 
 		 409 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  30.71 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  34.42 
 
 		 490 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  31.56 
 
 		 652 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  29.83 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  28.81 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  29.57 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  32.63 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  26.89 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  26.32 
 
 		 900 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  23.3 
 
 		 1231 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  24.75 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  30.56 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  28.14 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  26.67 
 
 		 519 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  26.75 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  26.27 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  28.89 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  24.06 
 
 		 520 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  26.7 
 
 		 426 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  26.45 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  30.32 
 
 		 429 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  26.83 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  24.62 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  30.39 
 
 		 580 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  29.52 
 
 		 427 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  29.91 
 
 		 443 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  27.03 
 
 		 620 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.97 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  27.64 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  26.06 
 
 		 496 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  25.4 
 
 		 366 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  31.13 
 
 		 605 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  34.33 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  31.43 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  22.15 
 
 		 424 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  37.04 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  25.4 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>