52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5502 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1007    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  55.7 
 
 		 649 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  44.73 
 
 		 613 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 		 605 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  41.64 
 
 		 580 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  40.07 
 
 		 417 aa  203  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  42.81 
 
 		 427 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  40.27 
 
 		 901 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  39.34 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  40.53 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  39.73 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  38.95 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  30.88 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  30 
 
 		 524 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.6 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  26.82 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  34.04 
 
 		 755 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  27.8 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  28.32 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  32.12 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  34.75 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  31.82 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 330 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  31.9 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  34.29 
 
 		 723 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  31.86 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  33.33 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  33.33 
 
 		 300 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  33.04 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  33.04 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  37.93 
 
 		 669 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  24.66 
 
 		 519 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  29.23 
 
 		 641 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  32.35 
 
 		 932 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  25.77 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  28.48 
 
 		 348 aa  47.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  26.47 
 
 		 633 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  25.99 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  29.31 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  26.06 
 
 		 299 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.97 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  26.34 
 
 		 322 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  24.11 
 
 		 750 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  26.06 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.42 
 
 		 900 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  26.02 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  26.29 
 
 		 307 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  29.51 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  23.08 
 
 		 519 aa  43.5  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.53 
 
 		 469 aa  43.5  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>