60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1311 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  100 
 
 		 348 aa  707    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  50.65 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  38.56 
 
 		 367 aa  238  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  33.62 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  34.02 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  30.13 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  28.12 
 
 		 519 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  31.82 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  32.28 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  28.75 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  26.28 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  27.35 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  27.06 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  32.14 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.88 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  27.57 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  25.27 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  33.76 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  25.09 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  28.72 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  29.38 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  29.69 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  32.63 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  32.63 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  33.7 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  29.79 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.43 
 
 		 900 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  29.48 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  27.27 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  27.27 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  27.27 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  28.94 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  22.84 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.5 
 
 		 506 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 1231 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 591 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  26.77 
 
 		 335 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  31.21 
 
 		 652 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  31.54 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  25.56 
 
 		 366 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  28.03 
 
 		 577 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0950  hypothetical protein  30.59 
 
 		 530 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.184254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  25.19 
 
 		 613 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  23.62 
 
 		 644 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  28.12 
 
 		 880 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.05 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  28.48 
 
 		 496 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  27.44 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  29.95 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  29.2 
 
 		 605 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  26.18 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  28.68 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48536  predicted protein  31.87 
 
 		 486 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0226991  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  43.33 
 
 		 620 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  28.57 
 
 		 427 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.88 
 
 		 886 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  21.1 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  23.88 
 
 		 649 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>