49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1096 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1112    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  36.62 
 
 		 519 aa  276  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  23.94 
 
 		 300 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  23.94 
 
 		 285 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  23.53 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  24.32 
 
 		 285 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  31.48 
 
 		 900 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  29.44 
 
 		 314 aa  107  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  27.44 
 
 		 490 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  24.44 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  30.32 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  23.08 
 
 		 409 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  25.69 
 
 		 375 aa  94.7  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  25.56 
 
 		 351 aa  94  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  22.39 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  23.19 
 
 		 407 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 		 1231 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  23.98 
 
 		 335 aa  88.2  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  26.09 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  25.1 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  25.09 
 
 		 348 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  23.61 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  23.13 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  22.19 
 
 		 345 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  21.03 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  22.03 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  22.69 
 
 		 880 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.33 
 
 		 506 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  23.83 
 
 		 620 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.5 
 
 		 886 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  23.63 
 
 		 325 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  23.33 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  22.36 
 
 		 652 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.32 
 
 		 584 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.56 
 
 		 469 aa  51.2  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.14 
 
 		 558 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  22.78 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  22.43 
 
 		 314 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.34 
 
 		 532 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 376 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.33 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 591 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.47 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  21.99 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.38 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  27.27 
 
 		 577 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 590 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.07 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>