38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1016 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  716    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  38.02 
 
 
367 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  34.84 
 
 
348 aa  210  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  33.67 
 
 
358 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  27.87 
 
 
360 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  26.24 
 
 
519 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  27.34 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  27.4 
 
 
490 aa  93.2  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  29.08 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  28.44 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  28.79 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  28.2 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  25.25 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  25.65 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  24.19 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  24.28 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  24.28 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  25.1 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  22.44 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  25.47 
 
 
900 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  27.78 
 
 
520 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  27.67 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  23.81 
 
 
366 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  22.17 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  20.98 
 
 
1231 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  21.76 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  27.33 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  26.17 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  27.87 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  27.87 
 
 
314 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  23.68 
 
 
652 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  21.72 
 
 
880 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  27.83 
 
 
620 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  20.62 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  22.41 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  24.35 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  25.4 
 
 
302 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>