41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0602 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  719    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  34.14 
 
 
348 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  30.93 
 
 
367 aa  149  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  27.74 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  30.87 
 
 
358 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  29.2 
 
 
490 aa  89.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  26.79 
 
 
519 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  26.59 
 
 
519 aa  87.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  26.04 
 
 
900 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  29.96 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  28.21 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  27.54 
 
 
520 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  27 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  23.55 
 
 
533 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  24.35 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  25.1 
 
 
285 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  25.1 
 
 
300 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  24.78 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  23.61 
 
 
374 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  27 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  26.79 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  26.9 
 
 
409 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  25.84 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  26.27 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.47 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  26.27 
 
 
299 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  26.54 
 
 
880 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
1231 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  28.72 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  26.23 
 
 
314 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  27.43 
 
 
644 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  30.23 
 
 
613 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  25.47 
 
 
442 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  30.15 
 
 
605 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  25.99 
 
 
496 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  26.97 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  24.61 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  25.11 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  22.99 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  29.66 
 
 
620 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>