57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4957 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 		 409 aa  840    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.91 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.35 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.49 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.04 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  33.17 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 		 591 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.44 
 
 		 506 aa  99.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  30.74 
 
 		 577 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.13 
 
 		 532 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.27 
 
 		 584 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.38 
 
 		 857 aa  93.2  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 		 590 aa  93.2  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 		 728 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.05 
 
 		 558 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.98 
 
 		 701 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  28.66 
 
 		 583 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  23.84 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.9 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  26.34 
 
 		 815 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.76 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  24.54 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  25.1 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  24.5 
 
 		 711 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.51 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  39.02 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  39.02 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  39.02 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  25.42 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  28 
 
 		 694 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  32.53 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  24.6 
 
 		 490 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  27.34 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  32.53 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  36.36 
 
 		 580 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  24.03 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  33.33 
 
 		 900 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  35.44 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  27.67 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  30.53 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  27.33 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  31.33 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  28.85 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  36.71 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  25.32 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  27.97 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  27.97 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  36.84 
 
 		 901 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  31.33 
 
 		 334 aa  46.6  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  27.59 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  34.88 
 
 		 519 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  28.1 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  21.76 
 
 		 519 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  27.82 
 
 		 496 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>