39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1778 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  861    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  37.81 
 
 		 524 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  39.8 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  34.87 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  30.22 
 
 		 901 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  29.41 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  28.21 
 
 		 613 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  31.58 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  34.02 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  30.42 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  26.11 
 
 		 680 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  32.64 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  32.07 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  27.81 
 
 		 533 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  26.97 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  26.91 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  28.87 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  28.66 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  32.14 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  39.17 
 
 		 300 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  39.17 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  34.07 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  40.16 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  25.77 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  32.04 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  36.04 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  29.55 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  30.25 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.67 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  30.32 
 
 		 302 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  30.32 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  25.57 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  26.09 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2364  hypothetical protein  25.67 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  34.71 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  27.27 
 
 		 900 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  26.53 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  24.18 
 
 		 321 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>