38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0293 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  892    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  64.49 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  55.17 
 
 		 901 aa  352  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  53.02 
 
 		 580 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  45.24 
 
 		 417 aa  257  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  41.84 
 
 		 613 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  43.48 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  43.39 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  42.71 
 
 		 605 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  43.15 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  37.13 
 
 		 496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  39.42 
 
 		 649 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  28.99 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  31.15 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  32.37 
 
 		 524 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  31.03 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  24.66 
 
 		 680 aa  64.3  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  26.64 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  30.91 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  31.45 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  31.45 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  25.25 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  31.45 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.84 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  25.84 
 
 		 520 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  29.09 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.44 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  28.93 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  30.91 
 
 		 307 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.06 
 
 		 900 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  37.35 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.18 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  29.91 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  29.91 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  36.14 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  24.34 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  24.55 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>