24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0558 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  754    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  33.81 
 
 		 901 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  34.8 
 
 		 580 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  30.96 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  31.49 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  31.35 
 
 		 613 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  30.45 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  31.21 
 
 		 376 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  33.21 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  30.88 
 
 		 496 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  30.45 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  30.9 
 
 		 605 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  30.57 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  27.4 
 
 		 649 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  27.53 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  27.89 
 
 		 490 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.86 
 
 		 519 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  28.22 
 
 		 900 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  28.11 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  28.24 
 
 		 520 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  26.64 
 
 		 519 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  25.49 
 
 		 285 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  25.74 
 
 		 285 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  25.74 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>