34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1060 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  721    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  61.25 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  58.62 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  59.48 
 
 		 533 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  47.96 
 
 		 580 aa  265  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  47.3 
 
 		 605 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  45.49 
 
 		 613 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  46.58 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  46.6 
 
 		 901 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  43.82 
 
 		 443 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  39.34 
 
 		 496 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  41.21 
 
 		 649 aa  182  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  30.62 
 
 		 380 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  26.69 
 
 		 524 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  32.64 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  25.74 
 
 		 680 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  27.19 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  26.54 
 
 		 520 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  33.05 
 
 		 490 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.32 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.77 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  29.9 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  35.4 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  35.4 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  28.21 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  24.14 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  26.6 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.95 
 
 		 383 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  25.23 
 
 		 900 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  30.77 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  31.43 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.6 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  31.43 
 
 		 299 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  29.46 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>