239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1472 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  58.43 
 
 		 584 aa  707    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  100 
 
 		 900 aa  1850    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  44.72 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  36.51 
 
 		 335 aa  225  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  38.36 
 
 		 343 aa  218  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  36.07 
 
 		 332 aa  205  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  38.49 
 
 		 312 aa  204  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  37.76 
 
 		 335 aa  204  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  40.65 
 
 		 409 aa  170  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  41.6 
 
 		 415 aa  170  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  34.43 
 
 		 545 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  42.29 
 
 		 407 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  34.98 
 
 		 300 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  41.53 
 
 		 442 aa  155  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  35.56 
 
 		 490 aa  154  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  38.59 
 
 		 285 aa  154  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  32.42 
 
 		 814 aa  154  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  36.51 
 
 		 285 aa  152  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  32.34 
 
 		 314 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  31.13 
 
 		 593 aa  140  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  30.07 
 
 		 378 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  31.91 
 
 		 572 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  35.83 
 
 		 351 aa  134  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  29.18 
 
 		 681 aa  134  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  32.48 
 
 		 519 aa  131  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  31.25 
 
 		 572 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  31.15 
 
 		 461 aa  130  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  28.97 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  29.87 
 
 		 578 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  28.45 
 
 		 673 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 		 332 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  29.87 
 
 		 589 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  29.14 
 
 		 621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  28.92 
 
 		 516 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  29.71 
 
 		 375 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  33.45 
 
 		 520 aa  117  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  30.58 
 
 		 519 aa  115  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  28.73 
 
 		 334 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 		 377 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  26.5 
 
 		 743 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  26.3 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 		 330 aa  107  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  29.39 
 
 		 533 aa  105  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  25.6 
 
 		 451 aa  99.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 502 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 		 1231 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  29.26 
 
 		 620 aa  95.9  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  24.4 
 
 		 370 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  26.53 
 
 		 335 aa  87.8  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  60.27 
 
 		 611 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  47.44 
 
 		 739 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  53.42 
 
 		 922 aa  79  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  56.94 
 
 		 567 aa  78.2  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  21.7 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  52.7 
 
 		 590 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  25.88 
 
 		 360 aa  76.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  45.65 
 
 		 961 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  30.77 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  50.68 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 736 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  53.42 
 
 		 639 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  51.35 
 
 		 591 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 649 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.41 
 
 		 842 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  23.17 
 
 		 365 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  49.37 
 
 		 415 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  35.59 
 
 		 948 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  23.21 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  52.86 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  50.63 
 
 		 554 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  28.3 
 
 		 366 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  52.86 
 
 		 484 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  52.63 
 
 		 580 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  50 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.22 
 
 		 644 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  25.47 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 563 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  33.9 
 
 		 588 aa  68.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  24.71 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 895 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  52.78 
 
 		 742 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.68 
 
 		 1051 aa  67.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  52.7 
 
 		 820 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  53.33 
 
 		 741 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 566 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  46.75 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  30.99 
 
 		 374 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  47.14 
 
 		 928 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.48 
 
 		 831 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 		 730 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  49.3 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  37.5 
 
 		 928 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  40.21 
 
 		 707 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 		 660 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  21.85 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  49.25 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  40 
 
 		 411 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>