63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1689 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 365 aa  760    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  41.57 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  35.84 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  30.55 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  26.82 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  29.86 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  31.17 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  25.72 
 
 		 588 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  29.6 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.05 
 
 		 343 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  30.17 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0251  glycoside hydrolase family 5  25.72 
 
 		 425 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  0.591379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.17 
 
 		 900 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  27 
 
 		 551 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  25.84 
 
 		 584 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  23.08 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  23.61 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  22.3 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  20.51 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.77 
 
 		 673 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  24.64 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  23.17 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  23.14 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  22.19 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  27.81 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  21.3 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4237  glycoside hydrolase family 5  24.71 
 
 		 653 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  21.74 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  26.24 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27.42 
 
 		 601 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  37 
 
 		 635 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 468 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  26.34 
 
 		 621 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  27.4 
 
 		 717 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  23.28 
 
 		 1221 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 502 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  27.09 
 
 		 451 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  28.23 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 493 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  26.11 
 
 		 545 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  27.54 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  25.79 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 814 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 556 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  22.16 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  23.79 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 566 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  22.4 
 
 		 572 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  26.42 
 
 		 368 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  20.23 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  22.22 
 
 		 863 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  24.02 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  25.5 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  23.33 
 
 		 481 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  24.68 
 
 		 486 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>