56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4499 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  100 
 
 
349 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  88.83 
 
 
349 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  52.29 
 
 
363 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  46.77 
 
 
347 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  45.12 
 
 
333 aa  293  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  45.74 
 
 
376 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  43.69 
 
 
420 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  40 
 
 
356 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  43.96 
 
 
635 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  39.08 
 
 
356 aa  255  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  40.78 
 
 
336 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  44.09 
 
 
709 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  40.26 
 
 
556 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  37.99 
 
 
340 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  34.92 
 
 
334 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  37 
 
 
326 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 
352 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  29.25 
 
 
749 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  31.69 
 
 
831 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 
814 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  22.93 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  19.93 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  29.77 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 
461 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  29.47 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.12 
 
 
584 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  23.61 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  26.42 
 
 
638 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  27.8 
 
 
533 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  21.08 
 
 
900 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  28.1 
 
 
400 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  25.98 
 
 
525 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  22.98 
 
 
561 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  23.86 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  20.68 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  22.77 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4600  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.53 
 
 
1194 aa  50.4  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  21.89 
 
 
475 aa  49.7  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 
660 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  21.46 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  33.64 
 
 
717 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  21.88 
 
 
470 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.06 
 
 
869 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 
468 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  24.88 
 
 
421 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  17.75 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  23.88 
 
 
470 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  30.7 
 
 
478 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 
847 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  26.92 
 
 
673 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 
443 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>