80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2014 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
501 aa  1024    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  40.61 
 
 
411 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 
335 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  37.59 
 
 
551 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  30.39 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 
493 aa  77.8  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  28.74 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  25.53 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  28.57 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  31.67 
 
 
335 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  24.63 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  27.51 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  27.54 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
343 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  25.22 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  27.08 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.05 
 
 
863 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  26.09 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  22.9 
 
 
588 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  24.89 
 
 
434 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.42 
 
 
900 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 
393 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  25 
 
 
847 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  20.66 
 
 
377 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 
468 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 
332 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 
365 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  20.45 
 
 
365 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  20.5 
 
 
673 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 
357 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  23.33 
 
 
748 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  25.19 
 
 
853 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25.42 
 
 
573 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27.78 
 
 
601 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  24.55 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.64 
 
 
584 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  22.64 
 
 
556 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  25 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 
705 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 
563 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  26.6 
 
 
661 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  22.07 
 
 
370 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  30.26 
 
 
1115 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 
561 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  23.83 
 
 
378 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  27.12 
 
 
539 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 
562 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  22.42 
 
 
329 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  24.06 
 
 
347 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.52 
 
 
869 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  24.1 
 
 
466 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 
472 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  22.44 
 
 
590 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4220  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.67 
 
 
2330 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.184212 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  25.69 
 
 
420 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  28.83 
 
 
382 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  22.78 
 
 
331 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  24.11 
 
 
1221 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  32.84 
 
 
610 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  25.87 
 
 
470 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  25.81 
 
 
337 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  25.95 
 
 
378 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  26.88 
 
 
457 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  29.63 
 
 
451 aa  47  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  26.46 
 
 
608 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  25.45 
 
 
1302 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  19.44 
 
 
566 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  27.04 
 
 
717 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  31.71 
 
 
426 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4292  cell surface protein  34.78 
 
 
936 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  27.05 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  21.15 
 
 
709 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  23.9 
 
 
358 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  22.22 
 
 
673 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  40.74 
 
 
1655 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>