76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2693 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 489 aa  1013    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  53.93 
 
 		 493 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  37.73 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  31.62 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  33.66 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  32.39 
 
 		 483 aa  234  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  31.42 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  26.87 
 
 		 590 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  26.21 
 
 		 1115 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  28.37 
 
 		 853 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  28.14 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  26.69 
 
 		 601 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 468 aa  100  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.2 
 
 		 673 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  27.76 
 
 		 705 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  25.54 
 
 		 863 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  25.47 
 
 		 370 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  28.29 
 
 		 551 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.69 
 
 		 869 aa  83.6  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  27.66 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  22.31 
 
 		 847 aa  74.3  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 365 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  23.37 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  26.36 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  25.08 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  21.84 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  27.51 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  24.76 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  23.12 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  21.31 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  23.53 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  20.07 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  25.41 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  35.85 
 
 		 661 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  20.58 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  22.56 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  30.43 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  21.23 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  28.19 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  24.47 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  22.53 
 
 		 900 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 566 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  24.89 
 
 		 490 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  24.89 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  28.49 
 
 		 358 aa  53.9  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 561 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  20.55 
 
 		 335 aa  53.5  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  21.86 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  27.59 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 		 365 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  25.48 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  20.2 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  22.29 
 
 		 562 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  32.33 
 
 		 827 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  21.89 
 
 		 328 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  25.98 
 
 		 526 aa  50.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  27.37 
 
 		 401 aa  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  22.94 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  21.27 
 
 		 561 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1682  hypothetical protein  24.9 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446852  normal  0.0463851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  23.64 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  22.63 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  23.98 
 
 		 523 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  22.87 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61452  glucan 1,3-beta-glucosidase  23.98 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 563 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  26.4 
 
 		 542 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  20.97 
 
 		 608 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>