49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1938 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  100 
 
 
401 aa  827    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  42.58 
 
 
393 aa  297  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  41.87 
 
 
382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  42.16 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  32.98 
 
 
368 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  32.11 
 
 
486 aa  152  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  31.42 
 
 
458 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  33.44 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  28.84 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  29.74 
 
 
827 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  28.72 
 
 
526 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  31.46 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  29.63 
 
 
402 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  28.84 
 
 
725 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_1372  predicted protein  30.03 
 
 
523 aa  97.4  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192993  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  27.54 
 
 
831 aa  89.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 
468 aa  87  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  26.84 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  23.59 
 
 
620 aa  80.9  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.88 
 
 
673 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.16 
 
 
863 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  31.91 
 
 
705 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56506  predicted protein  24.14 
 
 
594 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286813  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  32.82 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  24.68 
 
 
853 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01332  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  23.15 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56510  predicted protein  23.94 
 
 
664 aa  66.2  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  30 
 
 
869 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  26.82 
 
 
573 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27.6 
 
 
601 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
343 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 
847 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  26.14 
 
 
470 aa  56.6  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  28.34 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  25.21 
 
 
481 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  33.03 
 
 
481 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08947  Putative exo-beta-1,3-glucanase (GH5-family); member of the ScExg1-family (Eurofung)  26.97 
 
 
584 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.849577  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 
489 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92070  predicted protein  32.03 
 
 
770 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  34.18 
 
 
1115 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 
365 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  22.83 
 
 
590 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  30.7 
 
 
483 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  23.53 
 
 
551 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26901  predicted protein  24.19 
 
 
1082 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0257796  normal  0.0277181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  25.2 
 
 
580 aa  43.1  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  30.49 
 
 
608 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>