40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03300 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1088    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  34.89 
 
 
486 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  34.33 
 
 
431 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  32.64 
 
 
402 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  31.28 
 
 
438 aa  171  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  31.23 
 
 
458 aa  167  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  29.02 
 
 
368 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  28.35 
 
 
368 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  31.44 
 
 
725 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  31.32 
 
 
393 aa  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  26.89 
 
 
831 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  27.66 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  29.24 
 
 
401 aa  124  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  28.53 
 
 
827 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  28.39 
 
 
409 aa  116  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56506  predicted protein  22.27 
 
 
594 aa  100  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286813  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56510  predicted protein  24.73 
 
 
664 aa  98.6  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_1372  predicted protein  28.9 
 
 
523 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192993  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  32.81 
 
 
498 aa  93.6  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  24.31 
 
 
620 aa  93.2  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01332  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  30.91 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61452  glucan 1,3-beta-glucosidase  23.05 
 
 
506 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243086  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  23.99 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  29.1 
 
 
470 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 
468 aa  60.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  25.83 
 
 
601 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  25.79 
 
 
853 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  24.92 
 
 
705 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08947  Putative exo-beta-1,3-glucanase (GH5-family); member of the ScExg1-family (Eurofung)  24.78 
 
 
584 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.849577  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  26.67 
 
 
456 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  25.55 
 
 
590 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
847 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 
489 aa  50.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  26.95 
 
 
328 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26 
 
 
869 aa  47  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  23.43 
 
 
863 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.94 
 
 
673 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92070  predicted protein  23.33 
 
 
770 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>