54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02900 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
498 aa  1033    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61452  glucan 1,3-beta-glucosidase  28.35 
 
 
506 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243086  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  32.66 
 
 
368 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  29.57 
 
 
368 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  30.81 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  27.9 
 
 
438 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  26.89 
 
 
431 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  27.42 
 
 
382 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  26.14 
 
 
458 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  32.81 
 
 
526 aa  93.6  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  24.16 
 
 
402 aa  93.2  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  27.1 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  29.69 
 
 
831 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  25.55 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  28.22 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  26.84 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  25.22 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  27.36 
 
 
827 aa  80.5  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  25.97 
 
 
725 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  28.37 
 
 
853 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  26.15 
 
 
705 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  25.6 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  22.32 
 
 
620 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  28.57 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  27.45 
 
 
869 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  27.27 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_1372  predicted protein  25.33 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192993  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  26.29 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  24.21 
 
 
863 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  25.14 
 
 
346 aa  64.3  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 
343 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  20.73 
 
 
1115 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 
489 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.47 
 
 
673 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  26.92 
 
 
601 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56506  predicted protein  21.02 
 
 
594 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286813  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  26.98 
 
 
847 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25.85 
 
 
573 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.31 
 
 
493 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  24.19 
 
 
590 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92070  predicted protein  23.95 
 
 
770 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 
343 aa  50.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  21.57 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  27.27 
 
 
608 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 
377 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.05 
 
 
551 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 
329 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01332  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  25.13 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26901  predicted protein  20.91 
 
 
1082 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0257796  normal  0.0277181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  26.03 
 
 
378 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 
562 aa  43.9  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  29.01 
 
 
382 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  25.19 
 
 
717 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>