80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4045 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  62.3 
 
 
601 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
573 aa  1126    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  29.44 
 
 
590 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  29.95 
 
 
1115 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29.48 
 
 
863 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  30.11 
 
 
456 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  28.84 
 
 
481 aa  126  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 
493 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  29.84 
 
 
470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  27.94 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  27.94 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
489 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.4 
 
 
673 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  33.76 
 
 
853 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
847 aa  102  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 
343 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 
468 aa  97.8  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  28.73 
 
 
869 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  30.92 
 
 
486 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  31.52 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  27.94 
 
 
705 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 
377 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  32.62 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  35.84 
 
 
365 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  26.51 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.73 
 
 
551 aa  73.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  28.49 
 
 
438 aa  72  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  28.36 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  28.14 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  23.51 
 
 
409 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  25.26 
 
 
370 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  26.42 
 
 
458 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  26.37 
 
 
368 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  25.82 
 
 
402 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  27.32 
 
 
431 aa  61.6  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 
337 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  26.82 
 
 
401 aa  60.8  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 
402 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  27.18 
 
 
382 aa  60.8  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 
335 aa  60.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  25 
 
 
393 aa  60.1  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  25.42 
 
 
501 aa  58.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 
365 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.76 
 
 
312 aa  57  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  25.83 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  21.95 
 
 
411 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 
566 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  26.76 
 
 
470 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  25.57 
 
 
332 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26901  predicted protein  24.49 
 
 
1082 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0257796  normal  0.0277181 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  26.47 
 
 
725 aa  54.3  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 
359 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  28.37 
 
 
831 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  30.77 
 
 
358 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  25.3 
 
 
1194 aa  50.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 
658 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92070  predicted protein  28.12 
 
 
770 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  25.39 
 
 
378 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0138  hypothetical protein  28 
 
 
749 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  30.22 
 
 
434 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  28.93 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  23.58 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  22.33 
 
 
533 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 
561 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  27.45 
 
 
400 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.07 
 
 
406 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  24.57 
 
 
619 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  25.56 
 
 
827 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  25.2 
 
 
1414 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
563 aa  44.3  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 
343 aa  44.3  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  25.81 
 
 
346 aa  44.3  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  27.23 
 
 
387 aa  43.9  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  23.04 
 
 
620 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  29.05 
 
 
382 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  23.13 
 
 
526 aa  43.5  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  21.19 
 
 
814 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>