113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0670 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
312 aa  634    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  68.61 
 
 
335 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  61.94 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  52.73 
 
 
335 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  47.87 
 
 
343 aa  301  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  41.16 
 
 
332 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  38.49 
 
 
900 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  37.02 
 
 
584 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  32.14 
 
 
566 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  31.12 
 
 
370 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  27.45 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 
814 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  30.45 
 
 
545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
377 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 
365 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 
357 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  27.59 
 
 
378 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 
373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  27.55 
 
 
593 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  25.57 
 
 
469 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  25.89 
 
 
621 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  29.15 
 
 
337 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  25.16 
 
 
475 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  26.02 
 
 
572 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
359 aa  95.5  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  23.99 
 
 
516 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 
502 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 
329 aa  90.1  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  29.32 
 
 
551 aa  89.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  25.48 
 
 
743 aa  89.7  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  24.26 
 
 
589 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  24.81 
 
 
681 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  26.12 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  26.52 
 
 
588 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  23.28 
 
 
572 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 
501 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  25.67 
 
 
378 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  25.86 
 
 
578 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  22.64 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  24.78 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  25.22 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  26.15 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  23.38 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  20.86 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  30.77 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  21.67 
 
 
489 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  23.13 
 
 
673 aa  65.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  23.55 
 
 
483 aa  63.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  20.65 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  24.19 
 
 
481 aa  62.4  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  22.33 
 
 
673 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2362  glycosy hydrolase family protein  27.74 
 
 
491 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  24.73 
 
 
466 aa  59.7  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  21.5 
 
 
561 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  24.56 
 
 
635 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  21.18 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0022  hypothetical protein  23.32 
 
 
386 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  25.18 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  23.76 
 
 
573 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0251  glycoside hydrolase family 5  24.33 
 
 
425 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  0.591379 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 
468 aa  56.2  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  23.77 
 
 
748 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.57 
 
 
1221 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  27.36 
 
 
535 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  22.7 
 
 
601 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 
566 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  24.62 
 
 
717 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1473  glycoside hydrolase family 5  24.41 
 
 
382 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  21.96 
 
 
493 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 
709 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  22.03 
 
 
869 aa  52.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  20.9 
 
 
352 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  28.23 
 
 
451 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5206  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 
553 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5653  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 
553 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227096  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  29.29 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  26.61 
 
 
426 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  21.31 
 
 
481 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  20.62 
 
 
863 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
459 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  23.42 
 
 
376 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  27.07 
 
 
930 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  23.1 
 
 
847 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  21.49 
 
 
556 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  22.86 
 
 
590 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  22.84 
 
 
853 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  25 
 
 
1167 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  22.22 
 
 
457 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  24.36 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  23.49 
 
 
356 aa  46.2  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  25 
 
 
431 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  21.58 
 
 
486 aa  45.8  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  23.22 
 
 
626 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  24.6 
 
 
630 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  21.5 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  25.63 
 
 
755 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>