38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2344 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 352 aa  723    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  33.22 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  33.86 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  34.28 
 
 		 349 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  28.85 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  33.22 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  30 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  27.01 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  27.01 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  28.86 
 
 		 334 aa  136  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  32.54 
 
 		 635 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  33.33 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  30.95 
 
 		 709 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  31.35 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 		 556 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  29.46 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  27.65 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 		 814 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  26.04 
 
 		 831 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  24.4 
 
 		 749 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  27.37 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  25.74 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  24.2 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4600  glycoside hydrolase family protein  20.78 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  20.9 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  25.52 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  22.26 
 
 		 332 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  22.92 
 
 		 814 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  24.29 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  23.32 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  28.75 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  25.58 
 
 		 869 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.8 
 
 		 584 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  22.49 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  24.76 
 
 		 545 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>