56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1886 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  100 
 
 		 451 aa  920    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  69.56 
 
 		 426 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  54.97 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  66.15 
 
 		 638 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  65.56 
 
 		 630 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  54.41 
 
 		 610 aa  361  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  47.87 
 
 		 346 aa  274  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  53.66 
 
 		 1167 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  47.06 
 
 		 1302 aa  260  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  39.23 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  33.95 
 
 		 505 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  35.42 
 
 		 505 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  40.98 
 
 		 930 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  36.75 
 
 		 709 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  38.33 
 
 		 755 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  35.55 
 
 		 426 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  34.36 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  34.2 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  36.36 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  35.36 
 
 		 748 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  33.91 
 
 		 1221 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  32.78 
 
 		 717 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  65.08 
 
 		 574 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  27.14 
 
 		 481 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  27.8 
 
 		 703 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  26.38 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  28.05 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.18 
 
 		 1194 aa  64.3  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  29.03 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  24.79 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  21.46 
 
 		 1004 aa  60.5  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  32.19 
 
 		 869 aa  60.1  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  21.19 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  48.98 
 
 		 1053 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  23.99 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  36.76 
 
 		 1054 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 359 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  28.23 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  43.33 
 
 		 1146 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1204 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  22.83 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.27 
 
 		 551 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 501 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  27.86 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  26 
 
 		 593 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.39 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  24.6 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  20.33 
 
 		 332 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>