50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1941 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  100 
 
 		 347 aa  723    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  62.58 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  62.95 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  63.37 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  63.37 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  54.63 
 
 		 748 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  52.61 
 
 		 709 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  36.34 
 
 		 505 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  36.49 
 
 		 505 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  34.16 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  35.6 
 
 		 930 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  33.63 
 
 		 755 aa  189  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  33.44 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  32.91 
 
 		 1302 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  34.34 
 
 		 630 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  36.17 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  32.07 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  31.87 
 
 		 610 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  32.95 
 
 		 638 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1167 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  31.23 
 
 		 457 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  28.32 
 
 		 717 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.63 
 
 		 1221 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  25.25 
 
 		 626 aa  86.3  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  25.52 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  25.82 
 
 		 651 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  28.31 
 
 		 703 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  22.05 
 
 		 1194 aa  67  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  24.59 
 
 		 1004 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  21.86 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.83 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  22.87 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  23.19 
 
 		 768 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.55 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  23.11 
 
 		 584 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  20.96 
 
 		 335 aa  52.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  22.77 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  22.44 
 
 		 456 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  26.32 
 
 		 900 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  26 
 
 		 566 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  28.57 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  21.15 
 
 		 673 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  22.75 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  25.86 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  26.9 
 
 		 853 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  21.79 
 
 		 705 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>