57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03298 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  100 
 
 		 347 aa  711    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  61.73 
 
 		 376 aa  408  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  59.35 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  57.67 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  56.75 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  46.77 
 
 		 349 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  47.3 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  45.75 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  45.81 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  42.36 
 
 		 336 aa  262  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  43.04 
 
 		 635 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  43.99 
 
 		 709 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  40.97 
 
 		 340 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  37.06 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  38.46 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  37.71 
 
 		 556 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  33.54 
 
 		 749 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  28.19 
 
 		 869 aa  72.8  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 814 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  25.52 
 
 		 831 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  28.67 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  23.5 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  19.83 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  24.53 
 
 		 705 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  22.68 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 		 847 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  22.71 
 
 		 717 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 		 562 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  25.71 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  27.14 
 
 		 533 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  26.83 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 608 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  25.63 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  22.56 
 
 		 1194 aa  49.7  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  27.45 
 
 		 391 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  25.64 
 
 		 566 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  24.46 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  22.94 
 
 		 1115 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  29.58 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  28.57 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4600  glycoside hydrolase family protein  22.19 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  24.5 
 
 		 475 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.8 
 
 		 551 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  27.86 
 
 		 451 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  24.18 
 
 		 1004 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  25.98 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  32.32 
 
 		 638 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  24.72 
 
 		 497 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  20.42 
 
 		 335 aa  42.7  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>