212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3023 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  43.8 
 
 		 853 aa  690    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  100 
 
 		 869 aa  1778    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  58.84 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  49.87 
 
 		 705 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  33.22 
 
 		 847 aa  149  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.13 
 
 		 673 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  33.19 
 
 		 551 aa  127  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  30.07 
 
 		 1115 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  51.24 
 
 		 639 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  48.74 
 
 		 863 aa  118  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  48.72 
 
 		 877 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  47.46 
 
 		 1132 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  46.77 
 
 		 1167 aa  114  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  49.19 
 
 		 610 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  46.22 
 
 		 982 aa  112  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  45.3 
 
 		 673 aa  108  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  34.8 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  29.15 
 
 		 456 aa  105  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  37.93 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  43.8 
 
 		 1391 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  42.28 
 
 		 389 aa  101  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 		 493 aa  99.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  39.84 
 
 		 536 aa  99  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  29.88 
 
 		 590 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  24.02 
 
 		 470 aa  95.5  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  37.1 
 
 		 918 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  45 
 
 		 383 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  28.3 
 
 		 573 aa  92.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  29.17 
 
 		 601 aa  91.3  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  27.27 
 
 		 481 aa  90.9  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  39.17 
 
 		 541 aa  90.9  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  36.11 
 
 		 465 aa  90.1  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  39.02 
 
 		 884 aa  87.8  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  42.99 
 
 		 461 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  27.92 
 
 		 481 aa  86.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  39.34 
 
 		 1091 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  27 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  26.92 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  33.57 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  40.38 
 
 		 948 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  36.59 
 
 		 957 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1024 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.18 
 
 		 933 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  34.33 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  41 
 
 		 819 aa  78.2  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40.82 
 
 		 870 aa  75.5  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42 
 
 		 802 aa  75.5  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  25.25 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.21 
 
 		 1321 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.55 
 
 		 1338 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 1356 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.78 
 
 		 845 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 343 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  41.96 
 
 		 569 aa  72.4  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  26.69 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.82 
 
 		 823 aa  72  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 1380 aa  72  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  28.19 
 
 		 347 aa  72  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  32.37 
 
 		 801 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  27.2 
 
 		 368 aa  70.5  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35.64 
 
 		 1707 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  27.45 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  41.41 
 
 		 966 aa  68.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.76 
 
 		 719 aa  68.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.76 
 
 		 777 aa  67.4  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  39.56 
 
 		 1295 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  32.81 
 
 		 469 aa  67  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.78 
 
 		 1732 aa  64.7  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  33.9 
 
 		 954 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  30 
 
 		 401 aa  63.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  34.65 
 
 		 566 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  31.46 
 
 		 1262 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  34 
 
 		 855 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  26.02 
 
 		 1004 aa  63.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  36.73 
 
 		 840 aa  63.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  34.74 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  25.75 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  29.69 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  31.94 
 
 		 1035 aa  62.4  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  33.87 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  32 
 
 		 509 aa  62  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.73 
 
 		 2554 aa  61.6  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  31.78 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  27.78 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  35.2 
 
 		 1441 aa  61.6  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  66.67 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  29.35 
 
 		 1799 aa  61.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 1444 aa  61.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  28.32 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 335 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  25.87 
 
 		 566 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  24.24 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  33.98 
 
 		 786 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  33.68 
 
 		 798 aa  60.1  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  28.77 
 
 		 356 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  36.73 
 
 		 3295 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.46 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  27.49 
 
 		 827 aa  59.3  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  30.49 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>