51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0065 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 378 aa  749    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  54.84 
 
 		 1194 aa  378  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  30.06 
 
 		 533 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  29.49 
 
 		 525 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  26.77 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  27.23 
 
 		 717 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  23.83 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  24.33 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  20.39 
 
 		 930 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  24.79 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  21.9 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  25.22 
 
 		 651 aa  60.1  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  21.48 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  25.39 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  23.76 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  23.5 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  20.85 
 
 		 748 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  29.77 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  22.44 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  20.62 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  29.77 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  25 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  29.29 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1167 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  29.29 
 
 		 356 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  21.54 
 
 		 551 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  23 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  19.01 
 
 		 755 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  29.85 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  21.41 
 
 		 709 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  26.09 
 
 		 2305 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 562 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  22.26 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  25.82 
 
 		 703 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  28.09 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  23.31 
 
 		 1302 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  25 
 
 		 542 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  23.89 
 
 		 2310 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  25.13 
 
 		 1221 aa  46.2  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  28.04 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  24.74 
 
 		 610 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  22.02 
 
 		 580 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  24.9 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  25 
 
 		 638 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  23.49 
 
 		 608 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>