39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0077 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 400 aa  825    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  60.42 
 
 		 391 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  41.65 
 
 		 421 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  33.42 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  24.29 
 
 		 831 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  26.57 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 		 340 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  22.55 
 
 		 673 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  29.35 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  26.7 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  26.05 
 
 		 635 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 660 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  27.46 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  26.47 
 
 		 590 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  22.91 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  25.63 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  24.48 
 
 		 869 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  29.51 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  23.31 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  22.89 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  23.15 
 
 		 705 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  22.01 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 556 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  26.8 
 
 		 601 aa  46.6  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  25.35 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 847 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  25.21 
 
 		 863 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 814 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  27.64 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  27.45 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.23 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  28.69 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  28.04 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  21.83 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  22.82 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  25 
 
 		 1115 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>