72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6012 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  100 
 
 		 363 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  53.99 
 
 		 349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  52.34 
 
 		 349 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  47.73 
 
 		 347 aa  305  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  46.91 
 
 		 420 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  45.61 
 
 		 376 aa  288  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  45.85 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  42.77 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  42.12 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  38.28 
 
 		 635 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  41.9 
 
 		 709 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  40.13 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  37.01 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 556 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  34.34 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  36.18 
 
 		 326 aa  166  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  30.06 
 
 		 749 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 814 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  25.86 
 
 		 831 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  27.47 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  23.84 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  25.55 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  22.87 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  24 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  24.88 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  26.29 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  29.37 
 
 		 869 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  29.48 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  23.23 
 
 		 584 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  24.71 
 
 		 539 aa  52.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  20.19 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  30.77 
 
 		 601 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 		 562 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  20.89 
 
 		 900 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.84 
 
 		 1194 aa  50.4  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.36 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  23.99 
 
 		 461 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  23.05 
 
 		 847 aa  49.7  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4600  glycoside hydrolase family protein  19.36 
 
 		 390 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25.67 
 
 		 705 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  25.26 
 
 		 1115 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 563 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  27.14 
 
 		 853 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  23.92 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  22.36 
 
 		 814 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  23.77 
 
 		 717 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  24.87 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  32.76 
 
 		 2305 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  26.06 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  25.97 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  23.61 
 
 		 551 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  30.38 
 
 		 573 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  24.46 
 
 		 1414 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  24.24 
 
 		 863 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 660 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  32.43 
 
 		 542 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  20.13 
 
 		 621 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 		 658 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  28.12 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  23.12 
 
 		 545 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  25.85 
 
 		 533 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>