24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2924 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
461 aa  951    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4600  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 
390 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  26.04 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  35.16 
 
 
334 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  29.91 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  27.27 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  27.35 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  29.03 
 
 
336 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  29.49 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  23.87 
 
 
831 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  21.11 
 
 
356 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  24.45 
 
 
363 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  22.54 
 
 
356 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 
814 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  23.94 
 
 
349 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  26.67 
 
 
709 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  24.4 
 
 
349 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  23 
 
 
556 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  26.67 
 
 
635 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  24.81 
 
 
749 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 
493 aa  46.6  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 
472 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>