62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1066 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1066  cellulase  100 
 
 		 709 aa  1403    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  69.57 
 
 		 635 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  57.04 
 
 		 556 aa  328  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  50.62 
 
 		 420 aa  281  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  46.01 
 
 		 347 aa  277  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  47.95 
 
 		 333 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  48.25 
 
 		 376 aa  273  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  42.99 
 
 		 349 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  42.86 
 
 		 356 aa  248  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  44.09 
 
 		 349 aa  247  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  44.3 
 
 		 336 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  41.93 
 
 		 356 aa  243  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  41.9 
 
 		 363 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  40.61 
 
 		 326 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  40.72 
 
 		 340 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  40.13 
 
 		 334 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3763  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  47.47 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 352 aa  140  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4980  hypothetical protein  40.6 
 
 		 685 aa  137  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  32.73 
 
 		 749 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 814 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  28.22 
 
 		 831 aa  89  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4983  hypothetical protein  40.8 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  47.13 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  47.13 
 
 		 787 aa  70.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 		 461 aa  62  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.92 
 
 		 900 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.13 
 
 		 584 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4600  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 		 390 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 332 aa  55.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  26.96 
 
 		 391 aa  55.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  22.46 
 
 		 332 aa  55.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 		 847 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  26.14 
 
 		 399 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 		 362 aa  52.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.35 
 
 		 335 aa  52  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  27.03 
 
 		 523 aa  50.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  28.88 
 
 		 869 aa  50.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  29.25 
 
 		 1302 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 		 468 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 501 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  28.65 
 
 		 525 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 		 343 aa  47.8  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  23.11 
 
 		 621 aa  47.4  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.54 
 
 		 1194 aa  47  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  23.88 
 
 		 378 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  31.29 
 
 		 533 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 365 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  31.07 
 
 		 542 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.54 
 
 		 673 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  33.33 
 
 		 426 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  25.49 
 
 		 543 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  32.11 
 
 		 489 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  27.43 
 
 		 717 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  26.03 
 
 		 1294 aa  45.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.63 
 
 		 453 aa  44.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  26.03 
 
 		 1414 aa  44.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  26.03 
 
 		 1369 aa  44.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.26 
 
 		 312 aa  44.3  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  28.38 
 
 		 337 aa  43.9  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  23.44 
 
 		 421 aa  43.9  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>