30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3417 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 831 aa  1706    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  70.38 
 
 		 814 aa  1165    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 		 352 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  27.44 
 
 		 420 aa  96.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  27.45 
 
 		 635 aa  87.8  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  31.69 
 
 		 349 aa  82.8  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 556 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  27.71 
 
 		 336 aa  76.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  29.89 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  27.01 
 
 		 709 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  26.78 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  25.52 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  26.61 
 
 		 333 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  23.38 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  26.22 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  24.61 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  23.62 
 
 		 356 aa  60.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  24.78 
 
 		 363 aa  60.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  24.29 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  27.73 
 
 		 490 aa  54.3  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  21.84 
 
 		 334 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  30.29 
 
 		 434 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  21.52 
 
 		 422 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 393 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  27.51 
 
 		 421 aa  45.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  21.52 
 
 		 436 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  29.14 
 
 		 1004 aa  44.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 501 aa  44.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 493 aa  44.3  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>