24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3558 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  100 
 
 		 490 aa  988    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5206  glycoside hydrolase family protein  39.6 
 
 		 553 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5653  glycoside hydrolase family protein  39.6 
 
 		 553 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227096  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  32.14 
 
 		 661 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  32.19 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  30.87 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  41.35 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6164  glycoside hydrolase family 5  28.25 
 
 		 612 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1364  glycoside hydrolase family 5  28.19 
 
 		 618 aa  85.9  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00194405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5302  hypothetical protein  26.67 
 
 		 632 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00149118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3087  hypothetical protein  47.25 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1830  hypothetical protein  38.69 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03013  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08820)  25.1 
 
 		 763 aa  64.7  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0833  hypothetical protein  27.71 
 
 		 656 aa  62  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.982432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55209  predicted protein  30.68 
 
 		 912 aa  57  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  27.5 
 
 		 831 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06030  cytoplasm protein, putative  32.21 
 
 		 742 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749015  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 489 aa  53.9  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  23.69 
 
 		 551 aa  50.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  21.74 
 
 		 847 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  23.66 
 
 		 349 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  21.89 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  24.06 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>