93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0943 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
493 aa  1025    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  53.93 
 
 
489 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  37.92 
 
 
456 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  31.29 
 
 
470 aa  263  4.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  33.79 
 
 
481 aa  259  8e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  32.55 
 
 
483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  32.08 
 
 
481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  27.34 
 
 
590 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  28.92 
 
 
573 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  29 
 
 
601 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 
468 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  26.84 
 
 
863 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  29.89 
 
 
705 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  27.18 
 
 
1115 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  29.12 
 
 
853 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  29.71 
 
 
869 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 
343 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  38.33 
 
 
551 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.41 
 
 
673 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 
329 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
847 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  25.6 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 
501 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  25.23 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  29.06 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  26.67 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  22.57 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.17 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  23.85 
 
 
566 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  24.87 
 
 
486 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  22.87 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  23.26 
 
 
332 aa  64.3  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1682  hypothetical protein  27.84 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446852  normal  0.0463851 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  28 
 
 
401 aa  62  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 
357 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  31.18 
 
 
831 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 
561 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  25.29 
 
 
328 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  26.11 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  25.53 
 
 
661 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  23.94 
 
 
470 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  28.64 
 
 
368 aa  57  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  22.46 
 
 
335 aa  57  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  24.62 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  21.67 
 
 
472 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  25.26 
 
 
593 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.12 
 
 
584 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  27.62 
 
 
498 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  26.6 
 
 
827 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  24.1 
 
 
422 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  30.83 
 
 
458 aa  53.5  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  28.77 
 
 
725 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
337 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  22.81 
 
 
377 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  26.56 
 
 
395 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  22.06 
 
 
539 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  20.85 
 
 
608 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  28.26 
 
 
438 aa  50.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  27.08 
 
 
580 aa  50.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  24.27 
 
 
578 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  21.96 
 
 
312 aa  50.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  19.69 
 
 
900 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  19.45 
 
 
562 aa  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  23.8 
 
 
365 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  21.85 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  24.45 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 
365 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 
440 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  26.09 
 
 
431 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61452  glucan 1,3-beta-glucosidase  25.49 
 
 
506 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243086  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  25.42 
 
 
572 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 
658 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  23.22 
 
 
516 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  26.88 
 
 
542 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  24.21 
 
 
402 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  24.1 
 
 
358 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  25.56 
 
 
632 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 
814 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 
461 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  25.18 
 
 
1221 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  22.33 
 
 
563 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  29.46 
 
 
572 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  24.23 
 
 
400 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  24.43 
 
 
589 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
831 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  24.64 
 
 
387 aa  44.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  22.92 
 
 
480 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  23.16 
 
 
649 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  21.74 
 
 
681 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 
814 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>