48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0987 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 402 aa  819    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  49 
 
 		 365 aa  355  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  44.04 
 
 		 331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  44.93 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  39.18 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  38.07 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  40.62 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  36.21 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.26 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  22.32 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.17 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  21.07 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27.78 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.67 
 
 		 863 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  21.17 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  30.05 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  24.7 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  21.39 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  25.41 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  19.87 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  25.5 
 
 		 853 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  25.29 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.17 
 
 		 551 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  22.97 
 
 		 588 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 501 aa  49.7  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  25.45 
 
 		 486 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  21.36 
 
 		 1115 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  26.4 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  26.03 
 
 		 590 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.21 
 
 		 493 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  21.05 
 
 		 481 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  21.5 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  23.27 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  22.54 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  21.93 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 660 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  22.35 
 
 		 705 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  22.28 
 
 		 358 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  25.63 
 
 		 563 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  33.33 
 
 		 481 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>