65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39320 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  79.42 
 
 
481 aa  807    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  100 
 
 
481 aa  993    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  77.34 
 
 
483 aa  782    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  47.59 
 
 
470 aa  423  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  40.92 
 
 
456 aa  364  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 
493 aa  252  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  31.42 
 
 
489 aa  236  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  29.6 
 
 
601 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  28.84 
 
 
573 aa  126  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29.32 
 
 
863 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  27.41 
 
 
590 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  29.07 
 
 
853 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  29.96 
 
 
705 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 
847 aa  100  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.5 
 
 
673 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  23.33 
 
 
1115 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  27.27 
 
 
869 aa  90.5  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 
501 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  22.98 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  26.29 
 
 
498 aa  67.4  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  24.09 
 
 
551 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 
329 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 
561 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  26.39 
 
 
331 aa  60.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  26.67 
 
 
382 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
357 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  25.44 
 
 
486 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 
562 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  22.29 
 
 
332 aa  57  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26901  predicted protein  26.19 
 
 
1082 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0257796  normal  0.0277181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  23.78 
 
 
542 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
377 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  22.22 
 
 
566 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  21.81 
 
 
365 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  22.83 
 
 
608 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  24.31 
 
 
368 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  26.42 
 
 
393 aa  53.5  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  31.06 
 
 
831 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  25.21 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  21.81 
 
 
337 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 
337 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 
335 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  18.64 
 
 
378 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  24.25 
 
 
2305 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  22.36 
 
 
335 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  26.92 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  25.12 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  28.03 
 
 
458 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  26.67 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  22.78 
 
 
580 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  21.54 
 
 
358 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  21.05 
 
 
402 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  23.78 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  23.04 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  25.69 
 
 
661 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  27.56 
 
 
431 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  20.48 
 
 
368 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  25.61 
 
 
378 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  21.5 
 
 
2310 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  22.34 
 
 
434 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 
365 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  22.11 
 
 
393 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>