47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1290 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  100 
 
 
393 aa  815    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  54.74 
 
 
382 aa  464  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  42.58 
 
 
401 aa  297  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  34.62 
 
 
368 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  32.4 
 
 
368 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  32.29 
 
 
486 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  27.97 
 
 
346 aa  146  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  31.32 
 
 
526 aa  145  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  32.97 
 
 
438 aa  139  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  28.79 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  30.68 
 
 
431 aa  133  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  23.37 
 
 
402 aa  112  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  30.63 
 
 
831 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  29.15 
 
 
827 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  28.09 
 
 
725 aa  98.6  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  25.55 
 
 
498 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  23.4 
 
 
620 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56506  predicted protein  22.57 
 
 
594 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286813  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_1372  predicted protein  25.55 
 
 
523 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192993  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01332  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  26.63 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29.26 
 
 
863 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  22.66 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56510  predicted protein  22.84 
 
 
664 aa  69.7  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  29.38 
 
 
853 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  32.03 
 
 
705 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 
847 aa  63.2  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  27.17 
 
 
590 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 
573 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 
493 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  29.75 
 
 
470 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.74 
 
 
869 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 
343 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  19.66 
 
 
673 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  26.42 
 
 
481 aa  53.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  25.62 
 
 
601 aa  53.1  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  25 
 
 
1115 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  21.25 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  22.94 
 
 
489 aa  49.7  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  25.81 
 
 
481 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  30.6 
 
 
483 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08947  Putative exo-beta-1,3-glucanase (GH5-family); member of the ScExg1-family (Eurofung)  30.71 
 
 
584 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.849577  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  26.27 
 
 
551 aa  46.2  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 
329 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  21.18 
 
 
562 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92070  predicted protein  24.26 
 
 
770 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61452  glucan 1,3-beta-glucosidase  21.15 
 
 
506 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>