54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0671 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
331 aa  681    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  58.36 
 
 
329 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  56.19 
 
 
328 aa  368  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  48.57 
 
 
378 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  46.13 
 
 
382 aa  314  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  44.04 
 
 
402 aa  312  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  45.02 
 
 
365 aa  293  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  41.53 
 
 
337 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 
357 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  24.27 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  26.32 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  26.04 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  26.05 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  28.5 
 
 
551 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  24.53 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 
489 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  27.27 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27.78 
 
 
601 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  27.03 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  24.29 
 
 
573 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  25.32 
 
 
470 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  22.59 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  25.68 
 
 
483 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  24.69 
 
 
588 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  26.39 
 
 
481 aa  60.1  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  22.19 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  26.38 
 
 
863 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  27.81 
 
 
853 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  29.41 
 
 
486 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.16 
 
 
584 aa  52.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 
501 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 
556 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  22.22 
 
 
869 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.96 
 
 
900 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  24.1 
 
 
566 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.38 
 
 
673 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  23.5 
 
 
847 aa  49.3  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  28.35 
 
 
438 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0190  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  28.95 
 
 
497 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  26.6 
 
 
673 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  25.37 
 
 
545 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  21.89 
 
 
468 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  23.98 
 
 
590 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  22.97 
 
 
681 aa  46.2  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  22.5 
 
 
705 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  29.41 
 
 
479 aa  46.2  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  34.85 
 
 
431 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 
332 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>