55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1511 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 411 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  40.69 
 
 		 501 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  27.53 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  25.82 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 		 489 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  25.66 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  24.34 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  24.34 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  25.63 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  25.52 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  24.16 
 
 		 456 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  24.68 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  21.63 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.81 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1682  hypothetical protein  25.39 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446852  normal  0.0463851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  25.37 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.83 
 
 		 673 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.38 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  21.88 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  21.2 
 
 		 329 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  21.95 
 
 		 573 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  24.16 
 
 		 481 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  21.74 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  22.08 
 
 		 900 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  20.2 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  23.08 
 
 		 590 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  20.95 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  23.11 
 
 		 584 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  23.26 
 
 		 480 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  26.87 
 
 		 370 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  25.32 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  35.06 
 
 		 863 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  21.91 
 
 		 601 aa  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  27.27 
 
 		 869 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  23.21 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 608 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  22.46 
 
 		 847 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  24.17 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0259  glycoside hydrolase family 42 protein  24.9 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0628186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  20.18 
 
 		 556 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 		 468 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  21.34 
 
 		 470 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>