78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1902 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
359 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  47.99 
 
 
373 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  41.57 
 
 
365 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 
343 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  30.12 
 
 
337 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  28.74 
 
 
370 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  28.74 
 
 
588 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
343 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
377 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  27.42 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  24.11 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.77 
 
 
312 aa  93.2  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 
414 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  25.24 
 
 
332 aa  89.4  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  25.47 
 
 
900 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  25.93 
 
 
584 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  27.05 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 
501 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  21.77 
 
 
566 aa  69.3  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0251  glycoside hydrolase family 5  26.72 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  0.591379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4237  glycoside hydrolase family 5  24.91 
 
 
653 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  22.59 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
489 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  29.14 
 
 
635 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  23.42 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  24.05 
 
 
673 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  26.7 
 
 
1194 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  20.3 
 
 
329 aa  57  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 
468 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  29.32 
 
 
717 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  25.33 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  22.08 
 
 
365 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  24.56 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  26.2 
 
 
573 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  26.29 
 
 
451 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  27.34 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 
340 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  24.28 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  20.48 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  21.85 
 
 
493 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  23.44 
 
 
545 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  30.65 
 
 
709 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  21.03 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  27.27 
 
 
1221 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  26.35 
 
 
1004 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  23.95 
 
 
869 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  20.34 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  21.86 
 
 
673 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  25.6 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  25.15 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  23.97 
 
 
626 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  26.19 
 
 
486 aa  46.2  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  25.75 
 
 
589 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  20.33 
 
 
456 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  25.9 
 
 
1115 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  23.04 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  21.08 
 
 
566 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  23.04 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  28.57 
 
 
462 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  23.88 
 
 
863 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  19.71 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 
502 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  22.27 
 
 
470 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0764  glycoside hydrolase family 1  37.1 
 
 
489 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  37.1 
 
 
496 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  23.33 
 
 
516 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  25.95 
 
 
630 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  24.86 
 
 
601 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  21.84 
 
 
1167 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  23.56 
 
 
481 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  28.37 
 
 
930 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  21.99 
 
 
483 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>