50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0119 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 365 aa  745    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  49 
 
 		 402 aa  345  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  45.02 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  43.71 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  43.17 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  37.18 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  36.43 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  39.56 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  27.71 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25.67 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.3 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  25.24 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  35.2 
 
 		 573 aa  77  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  24.38 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  21.14 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  24.3 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  32.94 
 
 		 601 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.15 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  23.98 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  19.95 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  25.07 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  21.3 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  22.79 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  25.31 
 
 		 526 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  22.08 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  21.81 
 
 		 481 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  26.54 
 
 		 486 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  33.33 
 
 		 831 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.4 
 
 		 863 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  27.78 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  20.95 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  22.07 
 
 		 588 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  23.8 
 
 		 493 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  23.89 
 
 		 578 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 		 847 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  25.48 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  25 
 
 		 438 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  23.44 
 
 		 551 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  27.13 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  25.56 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  26.19 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  33.8 
 
 		 725 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  21.83 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  26.32 
 
 		 458 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>