42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0182 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 373 aa  751    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  47.85 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  35.84 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  33.24 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  26.91 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 343 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  31.91 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  27.01 
 
 		 588 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 343 aa  124  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.94 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  24.31 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  24.53 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  20.25 
 
 		 584 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 501 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0251  glycoside hydrolase family 5  28.24 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  0.591379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  22.29 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  23.75 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  21.37 
 
 		 900 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4237  glycoside hydrolase family 5  25.17 
 
 		 653 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  23.32 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  23.1 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  25.15 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  27.16 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  21.83 
 
 		 545 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  20.53 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 411 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  20.48 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  21.46 
 
 		 436 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  21.46 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  21.5 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  23.92 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  22.75 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  20.32 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  26.87 
 
 		 601 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.16 
 
 		 468 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>