39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1727 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  100 
 
 		 588 aa  1221    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 359 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  25.72 
 
 		 365 aa  120  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  26.4 
 
 		 378 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 343 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 377 aa  97.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 357 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.41 
 
 		 370 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  23.12 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 335 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.56 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  33.9 
 
 		 900 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  27.72 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  26.75 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  28.5 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  23.24 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  25 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  24.69 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  23.35 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  26.8 
 
 		 673 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  24.73 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  20.74 
 
 		 332 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  23.35 
 
 		 378 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 402 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  29.76 
 
 		 422 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  30.36 
 
 		 436 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  22.07 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0251  glycoside hydrolase family 5  24.34 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  0.591379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  27.78 
 
 		 434 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  22.04 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 		 393 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  25.79 
 
 		 387 aa  46.2  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  27.03 
 
 		 1004 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 		 847 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  24.32 
 
 		 349 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>