92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1842 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  100 
 
 		 551 aa  1141    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  32.3 
 
 		 853 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 343 aa  100  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  29.5 
 
 		 332 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 		 489 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  29.32 
 
 		 312 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  26.91 
 
 		 335 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  29.95 
 
 		 705 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  37.59 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.92 
 
 		 869 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  28.5 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 332 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  22.73 
 
 		 573 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  27.06 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  24.19 
 
 		 601 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  25.13 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  24.88 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  24.09 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  22.5 
 
 		 590 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  25 
 
 		 863 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.49 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  29.27 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  22.84 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  21.43 
 
 		 561 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  23.17 
 
 		 456 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  26.06 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  26.99 
 
 		 717 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  25 
 
 		 588 aa  60.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  24.09 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  27.15 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  23.6 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  24.65 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  27 
 
 		 2310 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  23.36 
 
 		 1115 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  21.74 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.48 
 
 		 584 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  28.25 
 
 		 608 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 563 aa  53.9  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  24.05 
 
 		 368 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  22.07 
 
 		 593 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  21.63 
 
 		 329 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 		 847 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  21.03 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  25.75 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  26.19 
 
 		 2305 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  21.84 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 337 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  24.36 
 
 		 368 aa  51.6  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  27.48 
 
 		 382 aa  51.6  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  25.81 
 
 		 900 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  22.17 
 
 		 402 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  21.43 
 
 		 357 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  20.8 
 
 		 566 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0285  glycoside hydrolase family 42 protein  23.72 
 
 		 383 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.696362  hitchhiker  0.00613688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  24.39 
 
 		 322 aa  50.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1167 aa  50.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 562 aa  50.4  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  22.52 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  23.69 
 
 		 490 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  26.98 
 
 		 431 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  22.38 
 
 		 378 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  29.17 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  20.99 
 
 		 814 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  22.07 
 
 		 451 aa  47.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 		 660 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 365 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  29.51 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  23.53 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  30.28 
 
 		 755 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  24.37 
 
 		 365 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  26.27 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  22.8 
 
 		 347 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  25.59 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  22.05 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  25.23 
 
 		 539 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  22.22 
 
 		 572 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  26.06 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  24.63 
 
 		 930 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0259  glycoside hydrolase family 42 protein  25.7 
 
 		 380 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0628186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  22.54 
 
 		 422 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  22.54 
 
 		 626 aa  43.5  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>