55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0888 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 337 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  42.06 
 
 		 331 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  40.06 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  37.08 
 
 		 402 aa  242  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  40.48 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  39.41 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  38.46 
 
 		 378 aa  231  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  37.42 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 357 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  27.72 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  22.73 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  34.23 
 
 		 601 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  25.63 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  26.41 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.73 
 
 		 863 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  31.33 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  21.79 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  23.08 
 
 		 584 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.47 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  28.83 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  27.44 
 
 		 590 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.68 
 
 		 673 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  28.95 
 
 		 853 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 493 aa  52.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  34.13 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  30 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  24.43 
 
 		 551 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  29.61 
 
 		 481 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  24.63 
 
 		 456 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  32.26 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  20.25 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  29.05 
 
 		 483 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  21.24 
 
 		 900 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 526 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  26.84 
 
 		 1115 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  25.71 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  25.5 
 
 		 2305 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  22.17 
 
 		 501 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  23.72 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  28.99 
 
 		 869 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  20.32 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  22.81 
 
 		 673 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 556 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  24.26 
 
 		 619 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  27.04 
 
 		 705 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  24.79 
 
 		 717 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  25.56 
 
 		 498 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>