106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0276 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  100 
 
 
335 aa  690    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  61.86 
 
 
332 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  68.61 
 
 
312 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  60.13 
 
 
335 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  49.41 
 
 
343 aa  334  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  37.76 
 
 
900 aa  205  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  36.4 
 
 
584 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  39.35 
 
 
332 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 
814 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  30.48 
 
 
566 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  35.79 
 
 
545 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  26.23 
 
 
378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  26.21 
 
 
370 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  30.8 
 
 
593 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  30.21 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  27.58 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 
365 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  27.81 
 
 
621 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 
357 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 
377 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  25.76 
 
 
475 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  29.43 
 
 
681 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  26.4 
 
 
572 aa  99.4  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  29.03 
 
 
578 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  27.18 
 
 
589 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  25.6 
 
 
743 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  28 
 
 
516 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 
359 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  27.91 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  25.3 
 
 
451 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  27.74 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  26.91 
 
 
551 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 
329 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  31.67 
 
 
501 aa  77  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  24.53 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  24.7 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  23.42 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  26.14 
 
 
673 aa  69.3  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  26.75 
 
 
588 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  24.83 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  30.65 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  29.03 
 
 
451 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.3 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  23.35 
 
 
1221 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  23.96 
 
 
535 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  21.68 
 
 
402 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  23.46 
 
 
869 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  29.41 
 
 
1302 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  23.83 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  25.12 
 
 
853 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  28.23 
 
 
638 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  30.16 
 
 
457 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  23.47 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  29.23 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  22.98 
 
 
363 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  27.42 
 
 
630 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  22.46 
 
 
493 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  23.38 
 
 
411 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2362  glycosy hydrolase family protein  23.97 
 
 
491 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  32.03 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 
709 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  27.86 
 
 
466 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1473  glycoside hydrolase family 5  23.96 
 
 
382 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  26.81 
 
 
505 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  20.55 
 
 
489 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  21.79 
 
 
561 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  28.46 
 
 
717 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  22.46 
 
 
414 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 
566 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  24.49 
 
 
483 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  21.02 
 
 
673 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  25.36 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  26.81 
 
 
505 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4237  glycoside hydrolase family 5  24.39 
 
 
653 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  27.27 
 
 
930 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  23.36 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  20.56 
 
 
542 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  24.23 
 
 
486 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  27.56 
 
 
610 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  22.36 
 
 
481 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  22.95 
 
 
748 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  24.39 
 
 
481 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  24.43 
 
 
1167 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  18.86 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  23.88 
 
 
601 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  24.15 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  21.94 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  22 
 
 
709 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  26.53 
 
 
755 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  19.41 
 
 
456 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  21.43 
 
 
420 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  21.72 
 
 
590 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  21.94 
 
 
705 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0022  hypothetical protein  21.53 
 
 
386 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>